Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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