Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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