Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms