Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms