Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP140Q13342 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP140Q13342 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SP140Q13342 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP140Q13342 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP140Q13342 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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SP140Q13342 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP140Q13342 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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