Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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