Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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PTGDRQ13258 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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PTGDRQ13258 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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PTGDRQ13258 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTGDRQ13258 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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PTGDRQ13258 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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PTGDRQ13258 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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PTGDRQ13258 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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PTGDRQ13258 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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PTGDRQ13258 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
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