Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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CBX3Q13185 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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