Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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