Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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