Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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