Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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KCNMA1Q12791 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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