Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms