Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms