Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms