Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC124947.1-201ENST00000552835 814 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC044839.1-208ENST00000634902 917 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AF064858.1-201ENST00000417335 1412 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SLC14A1-203ENST00000415427 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 WNT16-202ENST00000361301 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 KRTAP4-1-201ENST00000398472 1241 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 LAMTOR5-AS1-202ENST00000457535 817 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 OR10AE1P-201ENST00000606962 1029 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 KRTAP4-1-202ENST00000620667 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms