Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms