Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms