Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms