Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCALDP61601 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCALDP61601 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCALDP61601 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCALDP61601 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCALDP61601 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCALDP61601 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCALDP61601 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCALDP61601 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCALDP61601 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCALDP61601 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCALDP61601 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCALDP61601 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCALDP61601 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCALDP61601 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCALDP61601 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCALDP61601 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCALDP61601 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCALDP61601 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCALDP61601 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCALDP61601 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCALDP61601 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCALDP61601 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCALDP61601 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NCALDP61601 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCALDP61601 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCALDP61601 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCALDP61601 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCALDP61601 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCALDP61601 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCALDP61601 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCALDP61601 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCALDP61601 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCALDP61601 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCALDP61601 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCALDP61601 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCALDP61601 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCALDP61601 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCALDP61601 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCALDP61601 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCALDP61601 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCALDP61601 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCALDP61601 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCALDP61601 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCALDP61601 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCALDP61601 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCALDP61601 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCALDP61601 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCALDP61601 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NCALDP61601 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCALDP61601 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms