Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK2P53671 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms