Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms