Protein–RNA interactions for Protein: P51685

CCR8, C-C chemokine receptor type 8, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR8P51685 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR8P51685 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR8P51685 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR8P51685 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR8P51685 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR8P51685 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR8P51685 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR8P51685 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR8P51685 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR8P51685 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR8P51685 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR8P51685 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR8P51685 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCR8P51685 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms