Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms