Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms