Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms