Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms