Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms