Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms