Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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