Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms