Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKMT2P17540 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CKMT2P17540 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKMT2P17540 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms