Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME1P15531 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME1P15531 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms