Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRAFP15056 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRAFP15056 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRAFP15056 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRAFP15056 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRAFP15056 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRAFP15056 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRAFP15056 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRAFP15056 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRAFP15056 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRAFP15056 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms