Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH1P12830 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH1P12830 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH1P12830 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH1P12830 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH1P12830 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH1P12830 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH1P12830 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH1P12830 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH1P12830 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH1P12830 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH1P12830 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH1P12830 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH1P12830 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH1P12830 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH1P12830 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms