Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APODP05090 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APODP05090 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms