Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK1O94907 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK1O94907 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK1O94907 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK1O94907 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK1O94907 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK1O94907 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DKK1O94907 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK1O94907 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK1O94907 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK1O94907 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK1O94907 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK1O94907 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DKK1O94907 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK1O94907 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DKK1O94907 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms