Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIOO75962 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIOO75962 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TRIOO75962 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
TRIOO75962 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIOO75962 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIOO75962 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIOO75962 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIOO75962 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIOO75962 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIOO75962 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIOO75962 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIOO75962 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIOO75962 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIOO75962 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIOO75962 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms