Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMPRSS11DO60235 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMPRSS11DO60235 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMPRSS11DO60235 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMPRSS11DO60235 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMPRSS11DO60235 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMPRSS11DO60235 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMPRSS11DO60235 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMPRSS11DO60235 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMPRSS11DO60235 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMPRSS11DO60235 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMPRSS11DO60235 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMPRSS11DO60235 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMPRSS11DO60235 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMPRSS11DO60235 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMPRSS11DO60235 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMPRSS11DO60235 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMPRSS11DO60235 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMPRSS11DO60235 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMPRSS11DO60235 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMPRSS11DO60235 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMPRSS11DO60235 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS11DO60235 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms