Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CREB3O43889 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms