Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms