Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TO15178 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TO15178 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TO15178 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TO15178 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TO15178 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TO15178 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TO15178 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TO15178 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TO15178 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TO15178 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TO15178 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TO15178 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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