Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms