Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms