Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ISM1B1AKI9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms