Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q6

TNFRSF11A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms