Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAB39Q9Y376 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAB39Q9Y376 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAB39Q9Y376 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAB39Q9Y376 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAB39Q9Y376 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAB39Q9Y376 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CAB39Q9Y376 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAB39Q9Y376 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CAB39Q9Y376 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAB39Q9Y376 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAB39Q9Y376 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAB39Q9Y376 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAB39Q9Y376 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAB39Q9Y376 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAB39Q9Y376 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CAB39Q9Y376 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAB39Q9Y376 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms