Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFSF13BQ9Y275 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF13BQ9Y275 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFSF13BQ9Y275 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms