Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN8AQ9UQD0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN8AQ9UQD0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1228.2 ms