Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP24Q9UPU5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms